Η Φορολογική Διοίκηση έχει εξουσία να επαληθεύει, να ελέγχει και να διασταυρώνει την εκπλήρωση των φορολογικών υποχρεώσεων, την ακρίβεια των δηλώσεων και τον ορθό υπολογισμό και την καταβολή του οφειλόμενου φόρου.
Ο έλεγχος, όπως προσδιορίζεται από την εντολή ελέγχου, μπορεί να είναι πλήρης ή μερικός και να διενεργείται είτε στην εγκατάσταση του φορολογούμενου (εντόπιος έλεγχος) είτε σε άλλον τόπο με προσκόμιση στοιχείων (απομακρυσμένος έλεγχος).